Здравствуйте! мы с сыном и бывшим мужем живем в муниципальной квартире.

Ваш муж, насчет необходимости сначала заключить договор соц найма, а только потом вас вселить/"прописать" - вас нагло обманывает.
да, действительно, необходимость внесения изменений в ранее заключенный договор социального найма (в связи с вселением членов семьи) предусмотрена сч. 2 ст. 70 жк рф, но не до вселения, а после этого вселения!
при этом верховным судом рф ( п. 27 постановления пленума вс рф от 02.07.2009 n 14) постановлено, что несоблюдение этой нормы само по себе не является основанием для признания незаконным проживания члена семьи в спорной квартире.
в вашем заявлении (по форме № 6) в фмс о вашей регистрации в этой муниципальной квартире наверняка есть подпись вашего мужа, подтверждающая законность вашего вселения в эту квартиру в 2006 г.!
то же относится и к вашему сыну!
это есть необходимое и достаточное для любого суда доказательство законности и вашего, и сына вселения в эту квартиру и проживания в ней.
так что у вас совершенно равные права с мужем...
и прав выселить вас у него не больше, чем у вас выселить его.
удачи.