Можно ли официально уменьшить квартплату если прописано два человека, но один из них живет в другом городе?

Можно.
1. раз "переехал на пмж" в др. город, и живет там, то там пусть и регится по месту жительства, а тут- снимут с регучета. останется один зарегенный по месту жительства, на кот. и будут начислять за пользование комм. услугами, как на единств. проживающего.
2. если таки не "пмж", то может этот уехавший зарегиться там по месту пребывания, и тут- предъявить этот док о временной регистрации там, и на основании этого- просить перерасчет.
3. поставить счетчики и платить по счетчикам- только за факт. потраченные ресурсы, независимо от кол-ва проживающих, "прописанных", без всяких хлопот по регистрациям (и справкам о них) и перерасчетах.
----------------------
квартплаты не существует.
есть плата за соцнайм (найм) , за жилищные и коммунальные услуги.
при этом часть комм. услуг начисляют на кол-во проживающих при отсутствии счетчиков.