Может отец собственник квартиры выписать сына

Желание отца снять с регистрационного учета сына, без его на то согласия, вполне понятно, это можно сказать "по-отечески". Незадача в том, что отец сам наниматель жилого помещения, а квартира является собственностью муниципальной, то есть, государственная она. Все наниматели жилого помещения имеют равные права и, если Договор социального найма оформлен на необычайно заботливого папу, который следит за своевременным снятием близких родственников с регистрационного учета, то пусть не радуется, потому что он (папа) никакого приоритета перед другими не имеет. А потому, стоит вздохнуть глубоко, побеседовать с "блудным сыном" и убедить в том, что приватизация, - когда бесплатно передают квартиру в собственность граждан - дело хорошее и весьма прибыльное, квартиры нынче дорогие. Так что приватизируйте, продавайте (всю, а не по долям) и разъезжайтесь по новым двум. Удачи!