Могу ли я продать дом купленный за счет материнского капитала.

Да. Только есть небольшое "но".
Согласно законодательство РФ, недвижимость приобретенная с участием средств материнского капитала, должна оформляться на всех членов семьи, в том числе и на несовершеннолетних детей. Для того что бы продать собственность несовершеннолетнего ребенка на это необходимо получить разрешение органов опеки и попечительства. Органы опеки в таких случаях, обычно разрешают продажу недвижимого имущества несовершеннолетнего ребенка в случае приобретения на его имя другой недвижимости не уступающей по характеристикам продаваемой.
Проще говоря, если вы продаете недвижимость несовершеннолетнего, вы должны приобрести ему другую недвижимость не хуже той которую продаете, не зависимо от того купили вы ее за собственные средства или за средства материнского капитала.