Родной брат через суд хочет меня лишить прописки в общей квартире(я там не проживаю) могут меня выселить?

Теоретически может, практически - сложно. брату необходимо будет доказать в суде, что вы добровольно, а не из-за неприязненных отношений не проживаете в квартире, что вам никто не чинит препятствий к проживанию, что вы сознательно и злостно уклоняетесь от уплаты коммунальных платежей и т. д. хлопотно это...