Имеет ли право тсж взимать плату за квартиру с количества проживающих, но не прописанных в этой квартире?

Законно. Потому что платить за воду тот, кто пользуется, а не тот, кто прописан (зарегистрирован). Можете оспорить в суде, но может и не получиться, если соседи будут свидетельствовать, что не прописанные проживают. какой им смысл платить за Вас? Лучше счетчики поставьте, тогда плата по потреблению. фактическому